如何打开和检查 FCS 文件

1. 导入样本

可以先打开 FlowApp 示例数据熟悉界面；分析自己的数据时，选择导入文件并从设备中选取一个或多个 FCS 文件。

2. 核对样本和通道

选中样本后查看事件数和可用参数。根据需要观察的细胞群，将相关散射或荧光通道设为散点图横纵轴。通道名来自文件，可能因仪器和 panel 不同而变化。

3. 查看补偿状态和坐标轴

确认文件是否包含补偿信息，并检查当前视图显示的是何种补偿状态。补偿后的数据可能包含负值；若坐标轴从零开始截断，可能会隐藏部分分布。

参见补偿矩阵检查说明。

4. 结合实验问题绘制门控

在散点图上定义群体，并在门控树中整理层级。检查每个门对应的母群和通道；在解释结果前，应结合样本、对照和实验设计核对门的位置。

5. 整理样本并检查结果

按实验元数据整理相关样本，在分组视图中查看叠加图和描述性统计。导出报告前，核对样本范围、门控层级、百分比统计口径和报告语言。

常见问题

• 无法打开时，确认文件为有效 FCS 格式后重新导入。
• 通道名称不符合预期时，检查源文件中的参数名和元数据。
• 散点图看起来空白时，检查所选坐标轴、坐标变换和当前选中的门。
• 较大的数据集需要更多时间读取和绘制。