检查了什么
- 对平衡型、G1 富集、S 期富集和 G2/M 富集的合成分布进行 DNA 含量拟合,并与已知输入核对。
- 使用内置合成 DAPI、PI 文件检查 FCS 解析和细胞周期拟合流程。
- 对 FlowRepository 公开数据 FR-FCM-Z55E、FR-FCM-Z55H 进行预检,包括形态门、单细胞筛选和 PI 信号筛选,再导出以供参考比较。
结果可以说明什么
合成数据用于检查模型能否恢复已知输入。公开数据预检会将样本标记为候选、拟合需复核、背景对照或事件数不足;这些只是分流检查结果,不代表每个生物样本都已被正确分类,其中部分样本仍需人工复核。
公开数据与 Sam68 研究的补充图有关。FlowApp 在这里仅用于软件预检,不独立验证论文中的生物学结论。
如何复跑
在代码仓库中运行 npm run validation:cell-cycle:model、npm run validation:cell-cycle:fcs 和 npm run validation:cell-cycle:flowrepository。公开数据预检需要本地验证缓存中已有对应的 FlowRepository 文件。
数据来源:FR-FCM-Z55E、FR-FCM-Z55H;相关研究:Sam68 研究论文。
与参考软件是否一致是另一个问题。若要声称与 FlowJo 或 ModFit 结果一致,需要使用同一 FCS 文件、相同事件范围和相同模型,并提供独立记录的参考导出结果。
查看技术证据汇总(包括其他检查项目和已知限制)。